En pacientes con tumores periféricos, la rentabilidad diagnóstica de la PAAF es superior a la de la biopsia transbronquial (Nivel de evidencia IA, grado de recomendación A). El riesgo de neumotórax de la PAAF transtorácica varía entre el 20 y el 30% de los casos y es algo inferior si se utilizan agujas del calibre 18 (Nivel de evidencia 2B, grado de recomendación B). La evaluación inmediata por parte del patólogo o citólogo de la calidad de la muestra incrementa la tasa de diagnósticos (Nivel de evidencia 1B, grado de recomendación A).
Si se emplea aguja gruesa ( BAG ) a partir de calibre 19 G, es posible realizar diagnóstico histológico del tumor.